La Editorial UGD organiza su producción en diversas colecciones temáticas:
Mis Materias: Esta colección responde a uno de los objetivos prioritarios de una editorial universitaria: atender las necesidades de bibliografía de las y los estudiantes de la Universidad y dar a conocer la producción de docentes de las diferentes cátedras. Incluye textos base de las asignaturas que se dictan en las carreras de la Universidad, elaborados por los docentes de cada materia. También incorpora otros textos que forman parte de la bibliografía no producidos por la UGD (como códigos y compendios de leyes), los cuales cuentan con textos introductorios elaborados por referentes académicos de la UGD o especialmente invitados. Esta colección se realiza de manera conjunta con la Secretaría Académica de la Universidad.
Ciencia Abierta: Esta colección está pensada para dar a conocer y acercar a la comunidad los proyectos desarrollados por los investigadores de la UGD o las adaptaciones de tesis de posgrados dictados en la Universidad. Promueve la difusión de los resultados de las investigaciones realizadas por los miembros de la Universidad. Esta colección es diseñada de manera conjunta con la Secretaría de Investigación y Desarrollo, con el Instituto de Investigación en Regiones Transfronterizas Inteligentes (IRTI) y con la Dirección de Postgrado.
Pensamiento Transfronterizo, Regional y Latinoamericano:Esta colección reúne títulos de reflexión y debate acerca de las tradiciones políticas y culturales de la Argentina, la región transfronteriza de Brasil, Argentina, Paraguay y Latinoamericana. Le interesa dar cuenta de la construcción de debates públicos, educativos, culturales y la relación estratégica entre los países, con el énfasis puesto en los intercambios, tensiones, fusiones y acuerdos. Incluye publicaciones elaboradas por miembros de la Universidad o materiales provenientes de otras fuentes que resultan apropiados para promover la reflexión y el pensamiento crítico alrededor del vínculo, las fronteras, las formas de hacer, la producción económica y la vida cultural de estas latitudes. Esta colección, al igual que Ciencia Abierta, está acompañada por los/as referentes del IRTI, la Secretaría de Investigación y Desarrollo y la Dirección de Postgrado.
Magistrales: En esta colección se publican materiales que reflejan las ideas expuestas en diferentes actividades realizadas en la UGD por el impulso de sus diferentes áreas: clases abiertas, ciclos de debate, paneles, conferencias, simposios, etc., dictadas por especialistas y grandes personalidades de diversas disciplinas de la cultura nacional e internacional. Esta colección es acompañada y curada por el equipo de la Secretaría de Extensión y las autoridades departamentales de la UGD.